汕头保税区对“一区多园”模式总的设想是：紧紧围绕汕头保税区的发展定位，严格按照海关总署“一区多园”模式的要求，把汕头保税区划分成保税物流功能园、保税加工功能园和非保税业务功能园（高新技术产业园）三个功能园区。
    三个功能园区的基本构想
    主要是对区内已有开展保税业务的企业和尚未开发的区域，按照功能要求调整规划，规划成保税物流功能园和保税加工功能园；对现有经营运作的非保税业务企业，按照海关总署的要求，通过封闭围网与信息围网相结合的形式，从地理上把非保税业务相对集中起来,并用隔离围网加以隔开；而对个别规模较大又很难从地理上隔离的非保税业务企业，采用信息围网予以隔离，实行不同模式的监管。具体来说：
    保税物流功能园：按照海关总署的要求，充分运用保税仓储的政策优势和保税区专用码头广澳港一类口岸的优良港口条件，在临港区域规划建设保税物流功能园，重点发展临港物流业，以英国威尔信、法国西电的物流运作为示范带动，吸引跨国公司以保税区作为其全球营销网络的重要节点，开展现代物流的集散、分拨和配送业务。抓紧筹建保税区塑料交易市场，以专业化市场拓展大物流、大流通，建立面向粤东、服务全国的仓储物流基地。
    保税加工功能园：根据保税区发展保税加工的功能要求，围绕建设临港大型出口加工产业的目标，全力扶持成长性强、带动力大的大型加工企业。重点扶持大型、较大型生产加工企业，运用新技术、新设备、新工艺，提升产品档次，促进产业升级换代，延伸产业链，走规模扩张之路。以化工原料工业为重点，打造临港工业体系，形成保税加工支柱产业。做强做大以食用油脂、高级包装材料、纺织化纤、电子电器为主的生产加工产业群体，促进大规模保税加工产业基地形成。
    非保税业务功能园（高新技术产业园）：重点发展以生物工程技术和新材料为主体的高新技术企业。积极引导企业与高等院校、科研机构合作，创办技术研发中心，提高技术创新能力，发挥企业技术创新的主体作用。规划以现有的联亿生物工程、双骏生物制药项目为基础，以清华大学、北京大学和中科院等高等院校、科研机构为技术依托，尽快形成产、学、研一体化的生物工程高科技园，促进生物工程技术产业化基地形成。以华南理工大学、四川大学、中国电子科技大学为技术依托，形成人工合成氟金云母系列产品生产基地。

    （一）依托广澳港，整合汕头保税区内南端0.38平方公里土地资源，布设隔离围网，开展区港联动。区港联动对接的通道采取GPS等高科技监管手段进行有效监管。
    （二）以汕头保税区为依托的 “区港联动”保税物流园区首先为区内生产企业配套，借联动的契机，促进已成功运作的保税区物流企业加快发展。做大做强国际中转、配送、采购等现代物流功能。其次是以点带面，尽快将物流业务扩大到全市和粤东地区，满足临港工业发展的需要，实现区域发展与港口升级双向促进，构建以生产制造业物流为主，兼顾发展商贸物流的大规模、上档次、国际化的物流园区。
    （三）汕头保税区“区港联动”的保税物流园区将严格按国家的政策规定，设立对应的政府管理机构，进行合法、科学、有效的管理。在海关监管下规范运作。